総合医療センターは大学病院、高度急性期医療機関として持てる限りの機能を有する、本学グループ最大の「Flagship Hospital(旗艦病院)」として36診療科、最大ベッド数（1053床）、県内唯一のドクターヘリ基地指定を受けた高度救命救急センターと東洋一の規模を誇る総合周産期母子医療センターも併設されています。全36診療科がそれぞれ高度医療を担っていますが、common diseaseから高度先進医療まで専攻医として経験すべき症例を全て基幹病院にて経験できます。特に当院の特徴として、脊髄損傷年間200例、切断145例、低体重出生児が非常に多く経験できることが特筆されます。当科の特徴は「先進機器を用いたニューロリハビリテーション」、「高次脳機能障害外来」、痙縮外来に精力的に取り組んでおり（自科hp参照）、研究者の育成にも力を入れています。